Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXTL1Q92935 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXTL1Q92935 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXTL1Q92935 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXTL1Q92935 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXTL1Q92935 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EXTL1Q92935 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXTL1Q92935 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXTL1Q92935 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL1Q92935 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms