Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GATA6Q92908 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GATA6Q92908 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATA6Q92908 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GATA6Q92908 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GATA6Q92908 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GATA6Q92908 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GATA6Q92908 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms