Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROX1Q92786 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROX1Q92786 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROX1Q92786 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX1Q92786 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX1Q92786 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROX1Q92786 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROX1Q92786 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms