Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DPF3Q92784 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DPF3Q92784 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DPF3Q92784 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DPF3Q92784 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DPF3Q92784 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DPF3Q92784 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DPF3Q92784 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DPF3Q92784 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DPF3Q92784 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DPF3Q92784 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DPF3Q92784 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DPF3Q92784 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DPF3Q92784 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DPF3Q92784 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
DPF3Q92784 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DPF3Q92784 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DPF3Q92784 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DPF3Q92784 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DPF3Q92784 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DPF3Q92784 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DPF3Q92784 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DPF3Q92784 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DPF3Q92784 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DPF3Q92784 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
DPF3Q92784 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DPF3Q92784 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DPF3Q92784 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DPF3Q92784 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms