Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB40AQ8WXH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB40AQ8WXH6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB40AQ8WXH6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB40AQ8WXH6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB40AQ8WXH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB40AQ8WXH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB40AQ8WXH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms