Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF138Q8WVD3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF138Q8WVD3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF138Q8WVD3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF138Q8WVD3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF138Q8WVD3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF138Q8WVD3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF138Q8WVD3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms