Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSMCE1Q8WV22 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSMCE1Q8WV22 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMCE1Q8WV22 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSMCE1Q8WV22 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSMCE1Q8WV22 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMCE1Q8WV22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NSMCE1Q8WV22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMCE1Q8WV22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms