Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC7Q8WUI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC7Q8WUI4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC7Q8WUI4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC7Q8WUI4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC7Q8WUI4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC7Q8WUI4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC7Q8WUI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC7Q8WUI4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC7Q8WUI4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC7Q8WUI4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HDAC7Q8WUI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC7Q8WUI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC7Q8WUI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC7Q8WUI4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms