Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIPC3Q8TF64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIPC3Q8TF64 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIPC3Q8TF64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIPC3Q8TF64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC3Q8TF64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIPC3Q8TF64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIPC3Q8TF64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIPC3Q8TF64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GIPC3Q8TF64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIPC3Q8TF64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIPC3Q8TF64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIPC3Q8TF64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIPC3Q8TF64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms