Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HAVCR2Q8TDQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HAVCR2Q8TDQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HAVCR2Q8TDQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HAVCR2Q8TDQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HAVCR2Q8TDQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAVCR2Q8TDQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms