Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
USP32Q8NFA0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
USP32Q8NFA0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
USP32Q8NFA0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
USP32Q8NFA0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
USP32Q8NFA0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
USP32Q8NFA0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
USP32Q8NFA0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
USP32Q8NFA0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
USP32Q8NFA0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
USP32Q8NFA0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
USP32Q8NFA0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
USP32Q8NFA0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
USP32Q8NFA0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
USP32Q8NFA0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
USP32Q8NFA0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP32Q8NFA0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
USP32Q8NFA0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
USP32Q8NFA0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
USP32Q8NFA0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms