Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2A3Q8NEV1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSNK2A3Q8NEV1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK2A3Q8NEV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSNK2A3Q8NEV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSNK2A3Q8NEV1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms