Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER1Q8NEC5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CATSPER1Q8NEC5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CATSPER1Q8NEC5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CATSPER1Q8NEC5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CATSPER1Q8NEC5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CATSPER1Q8NEC5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPER1Q8NEC5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPER1Q8NEC5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPER1Q8NEC5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms