Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EHBP1Q8NDI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHBP1Q8NDI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHBP1Q8NDI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHBP1Q8NDI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EHBP1Q8NDI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EHBP1Q8NDI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EHBP1Q8NDI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EHBP1Q8NDI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EHBP1Q8NDI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms