Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIBP2Q8ND30 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIBP2Q8ND30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIBP2Q8ND30 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIBP2Q8ND30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPFIBP2Q8ND30 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIBP2Q8ND30 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIBP2Q8ND30 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIBP2Q8ND30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms