Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNLDC1Q8NA58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNLDC1Q8NA58 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNLDC1Q8NA58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNLDC1Q8NA58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNLDC1Q8NA58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PNLDC1Q8NA58 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNLDC1Q8NA58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNLDC1Q8NA58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms