Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC89Q8N998 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC89Q8N998 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC89Q8N998 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC89Q8N998 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC89Q8N998 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC89Q8N998 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC89Q8N998 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC89Q8N998 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms