Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8F6

YIPF7, Protein YIPF7, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF7Q8N8F6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YIPF7Q8N8F6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF7Q8N8F6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF7Q8N8F6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF7Q8N8F6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YIPF7Q8N8F6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIPF7Q8N8F6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF7Q8N8F6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF7Q8N8F6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms