Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO39Q8N4B4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO39Q8N4B4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO39Q8N4B4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO39Q8N4B4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO39Q8N4B4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO39Q8N4B4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO39Q8N4B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO39Q8N4B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FBXO39Q8N4B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO39Q8N4B4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO39Q8N4B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO39Q8N4B4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO39Q8N4B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO39Q8N4B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO39Q8N4B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms