Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZT9

FAM9C, Protein FAM9C, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM9CQ8IZT9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM9CQ8IZT9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM9CQ8IZT9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM9CQ8IZT9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM9CQ8IZT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM9CQ8IZT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM9CQ8IZT9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM9CQ8IZT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM9CQ8IZT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM9CQ8IZT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms