Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNJLQ8IV13 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNJLQ8IV13 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNJLQ8IV13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNJLQ8IV13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNJLQ8IV13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNJLQ8IV13 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCNJLQ8IV13 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNJLQ8IV13 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNJLQ8IV13 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNJLQ8IV13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCNJLQ8IV13 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNJLQ8IV13 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNJLQ8IV13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms