Protein–RNA interactions for Protein: Q86V40

TRABD2A, Metalloprotease TIKI1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2AQ86V40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRABD2AQ86V40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRABD2AQ86V40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRABD2AQ86V40 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRABD2AQ86V40 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRABD2AQ86V40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRABD2AQ86V40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRABD2AQ86V40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRABD2AQ86V40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRABD2AQ86V40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRABD2AQ86V40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRABD2AQ86V40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRABD2AQ86V40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRABD2AQ86V40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRABD2AQ86V40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRABD2AQ86V40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRABD2AQ86V40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRABD2AQ86V40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRABD2AQ86V40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRABD2AQ86V40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRABD2AQ86V40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms