Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4DQ86TL0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4DQ86TL0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4DQ86TL0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG4DQ86TL0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4DQ86TL0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG4DQ86TL0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG4DQ86TL0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4DQ86TL0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4DQ86TL0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms