Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NPM2Q86SE8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NPM2Q86SE8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NPM2Q86SE8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPM2Q86SE8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NPM2Q86SE8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NPM2Q86SE8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPM2Q86SE8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NPM2Q86SE8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NPM2Q86SE8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NPM2Q86SE8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NPM2Q86SE8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NPM2Q86SE8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NPM2Q86SE8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NPM2Q86SE8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NPM2Q86SE8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPM2Q86SE8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NPM2Q86SE8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPM2Q86SE8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPM2Q86SE8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms