Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WDR53Q7Z5U6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR53Q7Z5U6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR53Q7Z5U6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR53Q7Z5U6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR53Q7Z5U6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WDR53Q7Z5U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR53Q7Z5U6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR53Q7Z5U6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms