Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM144Q7Z5S9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM144Q7Z5S9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM144Q7Z5S9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM144Q7Z5S9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM144Q7Z5S9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM144Q7Z5S9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms