Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX8Q7RTT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX8Q7RTT4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX8Q7RTT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX8Q7RTT4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX8Q7RTT4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX8Q7RTT4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms