Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OTOP3Q7RTS5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTOP3Q7RTS5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP3Q7RTS5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
OTOP3Q7RTS5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTOP3Q7RTS5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OTOP3Q7RTS5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OTOP3Q7RTS5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTOP3Q7RTS5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTOP3Q7RTS5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OTOP3Q7RTS5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTOP3Q7RTS5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTOP3Q7RTS5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
OTOP3Q7RTS5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
OTOP3Q7RTS5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OTOP3Q7RTS5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTOP3Q7RTS5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms