Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf139Q6ZV77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf139Q6ZV77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf139Q6ZV77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf139Q6ZV77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf139Q6ZV77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf139Q6ZV77 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf139Q6ZV77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms