Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BEND4Q6ZU67 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEND4Q6ZU67 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEND4Q6ZU67 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEND4Q6ZU67 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEND4Q6ZU67 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BEND4Q6ZU67 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms