Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BNC2Q6ZN30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BNC2Q6ZN30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BNC2Q6ZN30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNC2Q6ZN30 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNC2Q6ZN30 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNC2Q6ZN30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BNC2Q6ZN30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNC2Q6ZN30 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms