Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFAP2EQ6VUC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAP2EQ6VUC0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFAP2EQ6VUC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAP2EQ6VUC0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2EQ6VUC0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAP2EQ6VUC0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2EQ6VUC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2EQ6VUC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms