Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL17Q6TDP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL17Q6TDP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL17Q6TDP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL17Q6TDP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL17Q6TDP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL17Q6TDP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL17Q6TDP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL17Q6TDP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL17Q6TDP4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms