Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CC2D1AQ6P1N0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CC2D1AQ6P1N0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CC2D1AQ6P1N0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CC2D1AQ6P1N0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CC2D1AQ6P1N0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CC2D1AQ6P1N0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CC2D1AQ6P1N0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1AQ6P1N0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1AQ6P1N0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CC2D1AQ6P1N0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CC2D1AQ6P1N0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.08■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CC2D1AQ6P1N0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D1AQ6P1N0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D1AQ6P1N0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms