Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RALGAPA1Q6GYQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALGAPA1Q6GYQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RALGAPA1Q6GYQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RALGAPA1Q6GYQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RALGAPA1Q6GYQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RALGAPA1Q6GYQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RALGAPA1Q6GYQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RALGAPA1Q6GYQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RALGAPA1Q6GYQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RALGAPA1Q6GYQ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RALGAPA1Q6GYQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALGAPA1Q6GYQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms