Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM198Q66K66 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM198Q66K66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM198Q66K66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM198Q66K66 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM198Q66K66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM198Q66K66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TMEM198Q66K66 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM198Q66K66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM198Q66K66 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM198Q66K66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM198Q66K66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM198Q66K66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms