Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRAGBQ5VZM2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRAGBQ5VZM2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RRAGBQ5VZM2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRAGBQ5VZM2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RRAGBQ5VZM2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRAGBQ5VZM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRAGBQ5VZM2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RRAGBQ5VZM2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RRAGBQ5VZM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRAGBQ5VZM2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRAGBQ5VZM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRAGBQ5VZM2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRAGBQ5VZM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRAGBQ5VZM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRAGBQ5VZM2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRAGBQ5VZM2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RRAGBQ5VZM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RRAGBQ5VZM2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RRAGBQ5VZM2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRAGBQ5VZM2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms