Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIPNQ5VXI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPNQ5VXI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPNQ5VXI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPNQ5VXI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPNQ5VXI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIPNQ5VXI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPNQ5VXI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms