Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BROXQ5VW32 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BROXQ5VW32 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BROXQ5VW32 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BROXQ5VW32 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BROXQ5VW32 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BROXQ5VW32 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BROXQ5VW32 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BROXQ5VW32 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BROXQ5VW32 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BROXQ5VW32 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BROXQ5VW32 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BROXQ5VW32 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BROXQ5VW32 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BROXQ5VW32 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BROXQ5VW32 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms