Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACHD1Q5VU97 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACHD1Q5VU97 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACHD1Q5VU97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACHD1Q5VU97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACHD1Q5VU97 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CACHD1Q5VU97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACHD1Q5VU97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACHD1Q5VU97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms