Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF3Q5TH69 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGEF3Q5TH69 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGEF3Q5TH69 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF3Q5TH69 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF3Q5TH69 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF3Q5TH69 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF3Q5TH69 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms