Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCO4Q5TGY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCO4Q5TGY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO4Q5TGY1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO4Q5TGY1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO4Q5TGY1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO4Q5TGY1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO4Q5TGY1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCO4Q5TGY1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms