Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FRMPD3Q5JV73 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FRMPD3Q5JV73 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD3Q5JV73 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD3Q5JV73 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD3Q5JV73 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD3Q5JV73 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD3Q5JV73 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD3Q5JV73 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD3Q5JV73 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FRMPD3Q5JV73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FRMPD3Q5JV73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD3Q5JV73 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FRMPD3Q5JV73 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD3Q5JV73 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD3Q5JV73 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD3Q5JV73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FRMPD3Q5JV73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRMPD3Q5JV73 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRMPD3Q5JV73 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms