Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRRC2BQ5JSZ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRRC2BQ5JSZ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRRC2BQ5JSZ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRRC2BQ5JSZ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRRC2BQ5JSZ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRRC2BQ5JSZ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRRC2BQ5JSZ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRRC2BQ5JSZ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRRC2BQ5JSZ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRRC2BQ5JSZ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRRC2BQ5JSZ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRRC2BQ5JSZ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms