Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CMPK2Q5EBM0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CMPK2Q5EBM0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMPK2Q5EBM0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMPK2Q5EBM0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMPK2Q5EBM0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMPK2Q5EBM0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CMPK2Q5EBM0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CMPK2Q5EBM0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms