Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSD17B12Q53GQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSD17B12Q53GQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSD17B12Q53GQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSD17B12Q53GQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms