Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL3Q4VX76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL3Q4VX76 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYTL3Q4VX76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYTL3Q4VX76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYTL3Q4VX76 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL3Q4VX76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYTL3Q4VX76 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms