Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R8

SLC22A6, Solute carrier family 22 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A6Q4U2R8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A6Q4U2R8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A6Q4U2R8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A6Q4U2R8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A6Q4U2R8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A6Q4U2R8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A6Q4U2R8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A6Q4U2R8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms