Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM229BQ4G0N7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM229BQ4G0N7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM229BQ4G0N7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM229BQ4G0N7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms