Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLEKHN1Q494U1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHN1Q494U1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHN1Q494U1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHN1Q494U1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHN1Q494U1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLEKHN1Q494U1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLEKHN1Q494U1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLEKHN1Q494U1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLEKHN1Q494U1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLEKHN1Q494U1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLEKHN1Q494U1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLEKHN1Q494U1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLEKHN1Q494U1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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